目的：回顾性分析转移性肺腺癌胸腔积液细胞的DNA倍体异常和表皮生长因子受体（EGFR）基因突变的关系，及其对肺腺癌患者预后的影响。方法：收集河北医科大学第四医院2012—2019年439例肺腺癌伴恶性胸腔积液患者的临床资料。使用计算机辅助DNA倍体定量分析系统检测胸腔积液中肺腺癌细胞DNA含量，计算大于5c细胞的百分比、大于9c细胞的数目、最大DNA指数（DI）值、大于5c细胞的平均DI值及非整倍体细胞峰。比较DNA倍体异常、EGFR基因突变各组间的差异，并检验DNA倍体异常与EGFR突变的相关性，分析DNA倍体异常及EGFR基因突变在肺腺癌预后中的价值。结果：439例肺腺癌患者中，共有244例（55.58%）检测出EGFR基因突变。与对照组比较，男性、有吸烟史、大于5c细胞的百分比＜14%、大于9c细胞的数目＜8、最大DI值＜6、大于5c细胞的平均DI值＜5的患者，其EGFR基因突变率降低（P＜0.05）。不同非整倍体细胞峰的EGFR基因突变率不同，双峰和单峰比无峰的EGFR突变率高（P＜0.05），而多峰与其他组的EGFR突变率差异无统计学意义（P＞0.05）。与EGFR野生型患者相比，EGFR突变型患者的大于5c细胞的百分比、大于9c细胞的数目、最大DI值、大于5c细胞的平均DI值及非整倍体细胞峰的平均秩次更高（P＜0.05），且上述5项指标均与EGFR突变均存在较弱的正相关关系（Kendall’s tau-b相关系数分别为0.186、0.153、0.110、0.156、0.148，均为P＜0.05）。单因素生存分析显示，大于5c细胞的百分比≥14%、大于9c细胞的数目≥8、EGFR突变患者的中位总生存时间较对照组患者长（P＜0.05）。多因素生存分析显示，EGFR基因突变是晚期肺腺癌患者的独立预后影响因素。结论：晚期肺腺癌患者中EGFR基因突变与DNA倍体异常存在关联，DNA倍体异常可能是预测EGFR基因突变的潜在指标。DNA倍体异常不是晚期肺腺癌患者的独立预后因素，但EGFR基因突变患者预后优于野生型患者。