目的：探讨EV71手足口病患儿检测神经元特异性烯醇化酶（NSE）、肌酸激酶脑型同工酶（CK-BB）、S-100B蛋白的临床意义。方法选择本院收治的50例重症手足口病患儿为重症组，50例普通型手足口病患儿为普通组，选择30例健康儿童为对照组，采用酶联免疫吸附法测定三组研究对象血清NSE和S-100B蛋白表达水平。采用电泳法检测CK-BB表达水平，比较三组研究对象血清NSE、S-100B及CK-BB表达水平的差异。结果重症组、普通组、对照组血清NSE、CK-BB、S-100B表达水平存在显著差异（P＜0.01），重症组患儿血清NSE、CK-BB、S-100B表达水平高于普通组，重症组及普通组患儿血清NSE、CK-BB、S-100B表达水平均高于对照组。结论手足口病患儿血清NSE、CK-BB和S-100B表达水平升高，其血清浓度与病情相关，检测血清NSE、CK-BB和S-100B表达水平对手足口病患儿的早期诊断及预后评估具有参考意义。