目的 从基因组学水平探讨清肝化瘀方药抗肿瘤的作用机制,以及丙酮预处理对抗癌中药含药血清的基因组学影响.方法 采用血清药理学与基因组学技术相结合的方法,提取肝癌患者服用清肝化瘀方药前的血清以及服药6周后的含药血清,将服药前后的含药血清用丙酮法进行预处理.将丙酮法预处理的含药血清体外培养肝癌SMMC-7721细胞,通过对基因芯片上的32 050个探针组检测,分析全基因组基因的表达差异.结果 服药后血清与服药前血清培养的细胞相比:基因表达上调≥2倍的有1 128个,基因表达下调≥2倍的有1 186个,分别占基因总数的3.52％、3.70％.差异表达的基因功能分类:上调的基因主要与信号传导途径、细胞凋亡有关；下调的基因主要与物质能量代谢、细胞增殖有关,差异表达的基因与抑制细胞生长有关.结论 清肝化瘀方药肝癌患者的含药血清,通过影响人肝癌SMMC-7721细胞的信号转导、细胞增殖与凋亡等基因的表达,从多靶点发挥对肿瘤细胞生长的抑制作用.丙酮预处理含药血清对肿瘤细胞凋亡、物质能量代谢相关基因的表达影响较明显.