背景与目的:贲门癌是常见的消化道肿瘤,预后差,5年生存率低.早期诊断是改善其预后的关键因素之一.近年来,蛋白质组学的迅速发展推进了肿瘤标志物研究的进程,其中基质辅助激光解析离子化飞行时间质谱(matrix assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)作为常用的蛋白质组学技术,成为检测和验证血液等体液肿瘤标志物的新技术及平台.本研究利用MALDI-TOF MS技术检测贵门癌患者血清蛋白指纹图谱,建立贲门癌诊断模型,探讨其临床应用价值.方法:收集河北医科大学第四医院2009年3月-2010年5月胸外科贲门癌患者血清63例和健康志愿者血清54例,采用弱阳离子蛋白芯片(WCX磁珠)对血清进行分析前处理,MALDI-TOF MS技术进行血清蛋白图谱检测,所得结果用ZUCI-蛋白芯片数据分析系统进行处理.运用遗传算法(genetic arithmetic,CA)结合支持向量机(support vector machine,SVM)运算建立贲门癌蛋白指纹图谱诊断模型:将117例标本随机分为训练组和盲法测试组,经训练后验证诊断模型的特异度和灵敏度.结果:采集贵门癌患者和健康对照者的血清蛋白指纹图谱,经数据对比分析找到69个有显著性差异的质荷比峰(P＜0.01);从中筛选出差异最显著的10个蛋白质荷比峰建立诊断模型(m/z分别为2 863、4 655、3 883、3 241、3 952、2 295、2 741、1 546、4 054和2 671).通过验证,该诊断模型的灵敏度为96.83%、特异度为90.74%.结论:应用MALDI-TOF MS技术能够检测贲门癌患者血清蛋白指纹图谱,建立贲门癌诊断模型.该模型在贲门痛诊断中具有较高的灵敏度和特异度,有一定的临床应用价值.