目的探讨肺腺癌组织runt结构域相关基因亚型3（RUNX3）甲基化状态和蛋白表达与新辅助化疗敏感性的关系。方法收集我院2018年9月至2019年9月就诊的116例ⅢA/ⅢB期肺腺癌患者的纤维支气管镜检组织标本,另收集30例肺鳞癌组织和30例肺部良性病变组织标本。采用免疫组化染色法和甲基化特异性PCR（MSP）检测组织中RUNX3蛋白表达和RUNX3甲基化状态。所有患者均完成2个周期新辅助化疗,采用RECIST 1.1版标准评价疗效。分析RUNX3蛋白表达和RUNX3甲基化状态与肺腺癌临床病理特征的关系。结果 TCGA数据库分析结果显示,RUNX3 mRNA在肺腺癌组织中表达显著下调（P(0.001）。RUNX3高表达组患者总生存率和无进展生存率优于RUNX3低表达组,差异有统计学意义（P(0.05）。良性对照组、肺鳞癌组、肺腺癌组组织RUNX3蛋白阴性表达率分别为3.33%（1/30）、23.33%（7/30）和55.17%（64/116）,差异有统计学意义（P(0.001）。良性对照组、肺鳞癌组、肺腺癌组RUNX3基因甲基化率分别为10.0%（3/30）、16.67%（5/30）和31.90%（37/116）,差异有统计学意义（P(0.05）。经Kappa一致性分析,肺腺癌组织RUNX3基因甲基化与RUNX3蛋白低表达结果一致性一般（Kappa=0.551,P(0.001）。肺腺癌组织RUNX3 mRNA甲基化和蛋白表达与吸烟史、新辅助化疗疗效有关（P(0.05）。结论 RUNX3基因在肺腺癌中呈高甲基化状态,是导致RUNX3蛋白表达下降的原因之一; RUNX3基因甲基化状态、RUNX3蛋白表达可以预测新辅助化疗疗效。