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富亮氨酸alpha2糖蛋白1在乳腺癌中的表达及其功能的生物信息学分析

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资源类型:

收录情况: ◇ 统计源期刊 ◇ 北大核心 ◇ CSCD-E

机构: [1]河北医科大学第四医院乳腺中心 河北石家庄 050011
出处:
ISSN:

关键词: 乳腺肿瘤 富亮氨酸α2糖蛋白1 预后 计算生物学

摘要:
背景与目的:富亮氨酸α2糖蛋白1 (LRG1)是富亮氨酸重复序列(LRR)家族蛋白成员,近些年研究显示LRG1在恶性肿瘤的发生、上皮间质转化、侵袭转移、异常血管生成、预后预测中发挥重要作用。然而LRG1在乳腺癌中的表达、预后、功能和潜在机制方面尚待阐明。本研究旨在通过生物信息学方法系统分析LRG1在乳腺癌中的表达及意义。方法:使用TCGA、 Breast Cancer Gene-Expression Miner、 UALCAN、 Kaplan-Meier Plotter、 Gene MANIA、DAVID等多个数据库对LRG1在乳腺癌中的表达与临床病理特征关系、预后价值、相互蛋白作用网络及功能富集进行综合分析。结果:TCGA数据库分析显示,LRG1 m RNA在乳腺浸润癌中的表达量明显高于正常组织(23.461 vs.8.357,P<0.001)。在不同分子亚型中,luminal型乳腺癌中LRG1 m RNA表达量为37.462 (9.930~74.197),高于HER-2阳性型乳腺癌和三阴性乳腺癌(TNBC)(均P<0.01);Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ期乳腺癌中LRG1 m RNA的表达水平均高于正常乳腺组织(均P<0.05)。Breast Cancer Gene-Expression Miner数据库分析显示,雌激素受体(ER)和(或)孕激素受体(PR)阳性乳腺癌中LRG1 m RNA的表达水平高于ER和(或) PR阴性乳腺癌,HER-2阴性乳腺癌中LRG1 mRNA表达高于HER-2阳性型乳腺癌(均P<0.05);淋巴结阳性乳腺癌LRG1 m RNA表达量高于淋巴结阴性乳腺癌(P<0.000 1)。用GEPIA在线平台对TCGA数据库中乳腺癌数据进行生存分析发现,LRG1高表达患者总生存率(OS)及无复发生存率(RFS)均低于低表达患者,但差异无统计学意义(HR=0.81, P=0.200; HR=0.70, P=0.064);用Kaplan-Meier plotter对TCGA中乳腺癌数据进行生存分析发现,LRG1的表达与luminal A型、luminal B型、HER-2阳性型乳腺癌的OS无明显关系(均P>0.05),但在basal-like亚型中,LRG1低表达患者OS明显优于LRG1高表达患者(HR=3.12,95%CI=1.54~6.29,P<0.001)。使用Gene MANIA数据库进行分析,共筛选出20个与LRG1相互作用蛋白质,GO富集分析显示,LRG1及与其共表达相关的20个蛋白富集于细胞胞外区,外泌体,血液微粒,受体复合物等结构中,参与细胞的血管生成调控、上皮间充质的转化、缺氧反应等相关生物学过程。结论:LRG1在乳腺癌组织中表达上调,并可预测部分不良乳腺癌亚型的预后,LRG1可能为乳腺癌治疗提供新的靶点。

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第一作者:
第一作者机构: [1]河北医科大学第四医院乳腺中心 河北石家庄 050011
通讯作者:
通讯机构: [1]河北医科大学第四医院乳腺中心 河北石家庄 050011
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