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◇ 统计源期刊
文章类型:
机构:
[1]河北医科大学第四医院口腔科
临床科室
口腔科
河北医科大学第四医院
[2]河北医科大学口腔医院口腔颌面外科
出处:
ISSN:
关键词:
口腔鳞状细胞癌
LAMB3
生物信息学
整联蛋白
摘要:
目的 基于生物信息学方法,通过HPA、TCGA和GEPIA等多个数据库探讨LAMB3在口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)中的表达及临床意义。方法 HPA数据库分析LAMB3 mRNA和蛋白在不同部位的表达。R软件通过TCGA数据库分析LAMB3 mRNA在OSCC和正常对照样本中的表达差异及与临床病理特征间的关系。GEPIA、TCGA数据库应用Log-rank法行预后分析。BioGRID数据库分析与LAMB3具有交互作用的基因。R软件通过TCGA数据库筛选LAMB3在OSCC中的共表达基因并行富集分析。STRING数据库筛选并构建LAMB3共表达基因的蛋白质互作网络(protein-protein interaction network,PPI network)。结果 人正常样本中LAMB3 mRNA在舌部表达最高。LAMB3蛋白在2例正常口腔黏膜样本和2例OSCC样本中均为中度表达。LAMB3 mRNA在OSCC中表达上调,与临床分期、年龄和总生存率相关,与肿瘤分化程度和性别不相关。OSCC中LAMB3的共表达基因中正相关145个、负相关4个。PPI network中具有相互作用关系最多的前10位基因里多为整联蛋白家族成员(ITGA3、ITGA5、ITGA6、ITGB4)。结论 LAMB3在OSCC中呈高表达,其高表达与年龄和临床分期相关且预后较差,并且与共表达基因中的整联蛋白在OSCC发生或发展相关的功能与通路的调控机制中关系密切,可为LAMB3为靶点的OSCC临床诊断或治疗提供新的研究方向和依据。
第一作者:
第一作者机构:
[1]河北医科大学第四医院口腔科
通讯作者:
通讯机构:
[1]河北医科大学第四医院口腔科
推荐引用方式(GB/T 7714):
崔子峰,宋绮雯,杨凯成,等.基于生物信息学分析lamb3在口腔鳞状细胞癌中的表达及意义[J].北京口腔医学.2023,31(4):241-246.