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◇ 统计源期刊
文章类型:
机构:
[1]河北医科大学第四医院放三科
河北医科大学第四医院
[2]河北医科大学第四医院胸外科
临床科室
胸心外科(胸外科 心脏血管外科)
河北医科大学第四医院
[3]河北师范大学生命科学学院
[4]河北医科大学第四医院外三科
临床科室
外三科
河北医科大学第四医院
出处:
关键词:
食管癌
ADP-核糖基化样因子5B(ARL5B)
临床病理学特征
Kaplan-Meier法
生物信息学分析
摘要:
目的 应用生物信息学技术探讨ARL5B的临床意义及可能的潜在作用机制,并通过临床资料、基础实验等进行了初步验证。方法 从TCGA数据库下载食管癌数据集,R软件分析差异表达的mRNA,结合患者的临床数据集进行生存分析。取临床食管癌及癌旁组织标本,采用实时定量PCR(qRT-PCR)及蛋白印迹(Western blotting)验证ARL5B表达。免疫组化检测ARL5B表达并评价其与食管癌患者临床病理特征的关系。利用生物信息学对ARL5B潜在作用机制初步分析,qRT-PCR初步验证可能与其作用的基因。结果 生物信息学结果显示ARL5B在人食管癌组织中的表达明显高于癌旁组织且ARL5B高表达是食管癌患者预后差的标志。淋巴结组织、肿瘤组织、癌旁组织中,ARL5B的mRNA和蛋白的表达由高到低,与生物信息学结果符合。临床分析表明ARL5B表达与肿瘤的淋巴结转移、临床分期有关,其高表达是患者预后差的标志。富集分析显示ARL5B与囊泡传输、内体传输、细胞器定位等生物学过程有关。蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)分析提示与ARL5B互作的蛋白质有VPS16、KIF1A、TOM1等。qRT-PCR验证表明,VPS16、KIF1A、TOM1的mRNA在食管癌组织中表达高于癌旁组织(n=60)且与ARL5B表达呈正相关。结论 食管癌中ARL5B存在高表达,与肿瘤淋巴结转移、临床分期及预后有关;ARL5B可能通过多种分子机制调控参与食管癌进展。
基金:
河北省科技厅卫生健康创新专项资助项目(No.21377785D)
第一作者:
第一作者机构:
[1]河北医科大学第四医院放三科
通讯作者:
通讯机构:
[1]河北医科大学第四医院放三科
推荐引用方式(GB/T 7714):
赵小涵,盖春月,王鹤松,等.食管癌组织arl5b表达与临床病理特征的关系及作用机制[J].西安交通大学学报(医学版).2024,45(02):237-243.