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p53相关基因il1a和f2r在胃癌中的表达及功能分析

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收录情况: ◇ 统计源期刊

机构: [1]河北医科大学第四医院 [2]上海市第六人民医院金山分院 [3]河北省儿童医院
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关键词: 胃肿瘤 P53 白细胞介素 1α 凝血因子Ⅱ凝血酶受体 生物信息学分析 生物标志物

摘要:
[目的]分析胃癌中P53相关基因白细胞介素1α(interleukin 1α,IL1A)、凝血因子Ⅱ凝血酶受体(coagulation factorⅡthrombin receptor,F2R)的表达及功能,寻找胃癌新的生物标志物。[方法]从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库获取胃癌的RNAseq表达数据和临床数据,包含375个胃癌组织和32个正常组织,从MSigDB获取P53相关基因集合。使用Fold Change和Wilcoxon检验筛选差异表达基因并对其进行富集分析、生存分析;计算P53相关基因在胃癌样本中的突变信息。选取临床中20例胃癌及癌旁组织样本,运用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)验证IL1A和F2R在胃癌及癌旁组织中的表达水平。[结果] TCGA数据库中,IL1A、F2R在胃癌样本中表达水平分别为13.31±2.07和18.69±0.92,均高于癌旁组织(P=0.003,P<0.001)。生存分析显示IL1A、F2R高表达胃癌患者的5年生存率更差(P=0.021,P=0.028),IL1A、F2R高表达是胃癌患者生存的危险因素。富集分析表明IL1A、F2R与细胞活化、炎症反应等相关。P53相关基因在胃癌样本中高频突变,有突变显著共出现(P<0.01)。临床病例中,RT-qPCR验证结果表明IL1A、F2R在胃癌组织中的表达水平均高于癌旁组织(P均<0.001)。[结论] IL1A、F2R在胃癌发生及进展中发挥作用,是潜在的胃癌生物标志物。

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第一作者机构: [1]河北医科大学第四医院
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