Expression of Purine-Arginine-Rich and Leucine-Rich Protein in Gastrointestinal Malignant Tumors and Its Correlation with Prognosis Based on Bioinformatic Analysis
[目的]观察脯氨酸/富亮氨酸末端富亮氨酸重复序列蛋白(purine-arginine-rich and leucine-rich protein,PRELP)在消化道恶性肿瘤中的表达及与预后的相关性,并探讨其在肿瘤微环境中与免疫浸润、免疫调节的关系.[方法]从癌症基因组图谱(The Cancer Genome At-las,TCGA)数据库和GTEx数据库获取PRELP在4种消化道肿瘤(食管癌、胃腺癌、结肠腺癌和直肠腺癌)中的RNA表达数据,并分析PRELP差异表达情况.分析PRELP与肿瘤预后的相关性并绘制Kaplan-Meier生存曲线.使用STRING数据库进行蛋白互作分析.对差异基因进行功能富集分析,探索生物功能和潜在通路.使用CIBERSORT计算4种癌症免疫细胞丰度,并对其与PRELP表达进行相关性分析.应用皮尔森相关性检验计算PRELP基因表达与免疫检查点基因表达相关性.通过qRT-PCR验证PRELP在不同消化道肿瘤临床样本中癌组织与癌旁组织的差异表达.[结果]PRELP在4种消化道肿瘤中的表达均低于正常组织(P＜0.001).PRELP高表达与胃腺癌、结肠腺癌、直肠腺癌的不良预后有关(P均＜0.05),而其低表达则与食管癌的不良预后有关(P＜0.05).PRELP水平与肿瘤免疫功能、免疫细胞丰度及免疫检查点表达水平相关.此外,qRT-PCR证实PRELP在癌组织与癌旁组织间的表达存在显著差异.[结论]PRELP与消化道恶性肿瘤临床预后相关,并在肿瘤微环境中与免疫浸润、免疫检查点表达呈显著相关性,PRELP可能可作为多种消化道肿瘤潜在的新的生物标志物和治疗靶点.
